Constituidos por miembros del Instituto, estarán orientados a estudiar determinados asuntos concretos de contenido técnico y emitir recomendaciones. Los objetivos de su actividad serán el fomentar una mayor involucración y participación de los miembros en las tareas y fines del Instituto; facilitar el intercambio profesional entre los miembros; fomentar las aportaciones del Instituto en foros e instituciones internacionales así como el intercambio de información relacionada con el derecho aeronáutico, del espacio y la aviación comercial con otras entidades u organismos públicos o privados.

El  resultado de los trabajos desarrollados en el seno de cada Grupo de Trabajo será presentado en las siguientes Jornadas Iberoamericanas que se celebren tras su correspondiente aprobación.

Actualmente están conformados los siguientes:

• Grupo de trabajo sobre Transporte aéreo:
  Director: José Manuel Gómez Pineda (España). Responsable: Gloria Argentina Alvarado Castro (Honduras).
  
  
• Grupo de trabajo sobre Medioambiente:
  Director: Alfonso Novales Aguirre (Guatemala). Responsable: Gloria Argentina Castro Alvarado (Honduras).
  
  
• Grupo de trabajo sobre Espacio:
  Directora: Sylvia Maureen Williams (Argentina). Responsables: Hebe Luisa Romero Talavera (Paraguay) y Elvira Prado Alegre (España).